馬來西亞產區分為東馬、西馬。西馬沉香外觀偏黃，香味較清甜；東馬所產色澤外黃內黑，香味較濃郁。該區沉香的外形種類頗為多樣，以鷹木樹種居多，有不少體積較大的形狀貨，雖歸屬星洲沉，但因緯度與惠安接近，亦有惠安系的蜜香樹種香氣特質，經常可看到軟絲棋楠種的品相，總體香氣與惠安沉接近，也有殼沉類。
東馬沉香以汶萊最為著名，味道多苦麻，近似棋楠種，用途廣泛。能沉水的馬來西亞沉香，是星洲沉香中雕材與珠材的上等品相；一般品第的馬來西亞沉香，亦是台灣製香原料的主要用材之一，也是沉香香料的重要產區。與印尼沉香一樣，多半集中在新加坡交易。如今，在越南芽莊產量極為稀少的情況下，越南當地市場所販售的沉香，多半混合馬來或邊界國家的品相，以統貨交易。2011年，筆者不論在大陸或越南，所見所聞，多半是馬來沉香。所以目前在越南或中國大陸買到的沉香，很多都是來自馬來西亞。

      馬來西亞沉香因為地理位置關係，有多種沉香樹種分佈，所以沉香的結油形狀呈多樣化，有鷹木類結油在外而將纖維包裹在內的結油方式，亦有惠安蜜香樹油質與纖維相間的結油方式。
東馬沉香常可見到軟絲棋楠種，好的東馬沉香色澤黑亮，味道甜緻濃郁，香氣純而不雜，濃而不膩。特別是汶萊所產的沉香，好的品相入口有苦麻感，結油質軟而密，是手珠用材的上等材質。

        產於東馬的生木黑棋，產區鄰近加里曼丹邊界，結油時受岩石擠壓，生聞時有明顯的棋楠甜韻。偶有形狀特殊的天然藝術品，此類品相也十分稀有珍貴，不可多得。

        早期因日本香道盛行，民間收購大量香道用的生木棋楠。目前棋楠價格高漲，加上日本長期經濟不振，很多日本收藏家及寺廟也開始出售手中珍藏的棋楠，但那些多半是二、三十年前柬埔寨、馬來西亞等地所產的生木棋楠，與越南芽莊棋楠尚有區別，讀者需自行分辨。